Le nom du village (anciennement « Temple le Sec ») vient des Templiers qui y avaient établi une commanderie dont l’existence est attestée dés 1252 et se nommait Domus Templi de Lagueos.

Après la disparition des Templiers, Temple-Laguyon devient en 1373 Praeceptoria Templi de Laqueo de l'ordre des Hospitaliers de Saint-Jean de Jérusalem et dépendra de la commanderie de Condac.

L’Eglise actuelle est le prolongement d’un corps de bâtiment qui était peut-être le corps de logis principal de la commanderie. A l’intérieur, on peut voir une décoration peinte du XVIIème Siècle.

Bien que le nom officiel de la commune soit Temple-Laguyon, elle est localement appelée Le Temple-Laguyon.

En occitan, la commune porte le nom de Lo Temple de Laguion.